您好！有案件公司可以办理注销，注销营业执照跟案子无关。

清算公司不论是何性质的清算，均应依下列步骤展开：

1、成立清算组。
2、展开清算工作。清算组自成立之日起接管公司，开展以下业务：接管公司财产、了结公司未了业务、收取债权、清理债务、分配剩馀财产、注销公司法人资格并吊销营业执照。
3、通知债权人申报债权。
4、提出清算方案。清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，拟定提出清算方案，报股东会讨论通过或者主管机关确认。
清算方案的主要内容有：清算费用、应支付的职工工资和劳动保险费、应缴纳的税款、清偿公司债务、分配剩馀财产、终结清算工作。在清算进行完以后，才能进行注销。
流程：
1、注销公司税务，获得税务注销登记证，
2、到公司主管工商局办理<公司注销备案>所需资料有：
公司营业执照复印件、公司股东会决议（内容就是注销公司，成立清算小组）、公司原始档案、到工商局领取表格。（这两步可同时办理）
3、登报公告（登报45日后在去注销公司）　注销登报公告需要到当地市级公开发行报刊办理。
注销公告需提供的材料
1营业执照副本复印件一份，
2.公司注销股东会决议。所需资料有：公司营业执照复印件、法定代表人身分证复印件、公告内容（**公司，准备注销请各债权债务人自见报45日内到我公司清算小组办理债权债务事宜）
4、登报45日后，再次到工商局办理注销申请所需资料有：公司营业执照原件（正副本）、税务注销证明文件、公司股东会决议、公司清算报告、工商局领取的表格、公司原始档案
5、到质监局注销代码证所需资料有：营业执照注销证明文件、代码证原件（正副本）至此，公司注销完毕。财产分配次序支付清算费用-》发放职工工资、社会保险费用-》清缴税款-》清还债务-》股东分配。
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