企业营业执照丢失后，注销流程如下：

1. 登报声明：首先，你需要在公开发行的省/市级报纸上登载营业执照丢失声明，这是法定的挂失程序，表明遗失者不再对遗失的营业执照负责，他人冒用产生的后果由冒用者承担。

2. 补办营业执照：

   • 准备《内资企业（公司）补发营业执照申请表》。
   • 提交《指定代表或者共同委托代理人授权委托书》及指定代表或委托代理人的身份证复印件。
   • 提供法人本人身份证原件及复印件。
   • 出具刊登营业执照正、副本遗失声明的报纸原件。
   • 如果公章遗失，还需要提供全档查询印章编号等材料。

3. 提交补照申请：

   • 向相关部门提交上述材料，办理补照手续。要求全体股东到场面签。

4. 办理注销手续：

   • 补办营业执照后，开始正式的注销流程。
   • 填写注销申请书，并加盖企业章。
   • 提交注销申请，包括营业执照正副本原件、税务出具的清税证明、股东会或董事会的决议（如有）、法定代表人身份原件及复印件等。
   • 税务注销：先去所在区税局注销税务，拿到清税证明。
   • 工商注销：拿到清税证明后，去管辖的市场监督管理局注销工商。
   • 如果有基本账户，还需去银行注销。

5. 完成清算：在注销过程中，可能需要成立清算组进行清算，处理未了结业务、清缴税款、清理债权债务等。

6. 公告与等待审批：部分注销流程可能需要在公开媒体上进行清算公告，公告期间无异议后，工商会办理注销手续。

整个过程可能需要60到90天，具体时间取决于公司的具体情况和当地政策。务必确保所有税务问题解决，避免留下不良记录。