公司长期零申报可能带来以下风险：
1. 税务风险
税务系统预警：长期零申报可能触发税务系统预警，被认定为 “非正常户”，导致发票被锁、无法办理涉税业务（如出口退税）。
罚款与滞纳金：税务局可追缴未报税款及滞纳金，并处以偷漏税款 0.5 倍至 5 倍的罚款。
刑事责任风险：情节严重者可能构成偷税罪，面临刑事责任追究。
2. 信用风险
企业信用降级：企业会被评为 D 级信用，影响政府采购、银行贷款等资格。
法定代表人影响：股东和法人的征信可能受损，导致出行受限（乘坐飞机、高铁）或被限制参与招投标。
3. 经营风险
发票限制：税务机关可能对违规企业采取更严格的管控措施，如限制领购数量、种类，甚至停止供应，严重影响企业正常经营。
经营受阻：在税务稽查期间或处理完毕前，企业可能面临频繁的税务检查，耗费大量时间和精力应对。
4. 法律风险
隐瞒收入：企业超过 6 个月以上没有收入和支出是比较异常的情况，可能被怀疑故意隐瞒收入。
虚增成本：长期不盈利可能存在虚增成本的风险。
个人所得税问题：所有员工收入都低于 5000 元可能存在员工是假的或通过其他渠道发工资的情况。
5. 其他风险
税收优惠政策享受风险：部分税收优惠政策要求企业在一定时期内有一定的纳税记录，长时间零申报可能导致企业无法享受这些优惠政策。
财务状况不清晰：无法准确掌握企业财务状况，可能导致错误经营决策。
为避免这些风险，企业应如实申报税务，加强财务管理，合理利用税收优惠政策，并与税务机关保持良好沟通。