注册深圳跨境电商公司的流程主要包括以下几步：
选择注册地址：
如果没有实际的办公地址，可以选择使用挂靠地址注册公司。
挂靠地址可以是白本地址或红本地址，其中红本地址更受市场欢迎，因为它在当地房管所有备案，可出具红本凭证，适用于公司注册、地址变更、前海公司年审、工商税务抽查等事项。
进行线上注册：
进入深圳跨境电子商务线上综合服务平台（www.szceb.cn）进行用户注册。
选择“企业用户注册”进入企业登记，业务类型勾选“通关业务”。
填写并上传相关资料后提交，资料包括但不限于公司基本信息、股东信息、经营范围等。
验证并办理开户：
提交成功后，及时联系平台客服在线验证并办理开户。
验证通过后，平台会以短信方式通知企业开户成功，并发送账号密码。
注意经营范围：
注册跨境电商公司时，经营范围一定要填上互联网销售。
涉及到跨境电商的需要包含货物进出口等外贸业务，以确保公司能够合法开展相关经营活动。