香港公司注册后申请商标和专利保护的步骤如下：

商标注册：

1. 检索商标：在申请前，先通过香港知识产权署的商标检索系统查询，确保没有相同或相似的商标已被注册。

2. 准备申请文件：准备商标注册申请书、商标图样以及相关费用。

3. 提交申请：将申请文件提交给香港知识产权署的商标注册处。

4. 审核过程：商标注册处会对申请进行形式审查和实质审查。

5. 公告：如果审查通过，商标会被公告，为期三个月，以供公众提出异议。

6. 注册：公告期满无异议或异议不成立，商标将被注册，并发放商标注册证书。

专利申请：

1. 专利类型选择：确定申请的专利类型，香港提供标准专利、短期专利和外观设计专利。

2. 准备申请文件：根据所选专利类型，准备相应的申请文件，包括申请书、专利说明书、权利要求书、图纸等。

3. 提交申请：将申请文件提交给香港知识产权署的专利注册处。

4. 审核过程：专利注册处会对申请进行形式审查和实质审查。

5. 授权：审查通过后，专利将被授权，并发放专利证书。